نرم افزار Avogadro
نرم افزار آووگادرو یک ویرایشگر و تجسم کننده مولکول است که برای استفاده بین پلتفرم در محاسبات شیمی، مدل سازی مولکولی، بیوانفورماتیک، علوم مواد و مناطق مرتبط طراحی شده است.
این نرم افزار رندر انعطاف پذیر با کیفیت بالا و معماری پلاگین قدرتمندی را ارائه می دهد. استفاده های معمول شامل ساخت ساختارهای مولکولی، قالب بندی پرونده های ورودی و تجزیه و تحلیل خروجی از طیف گسترده ای از بسته های شیمی محاسباتی است. با استفاده از قالب فایل CML به عنوان نوع اصلی سند، نرم افزار آووگادرو در تلاش است تا قابلیت دسترسی معنایی انواع داده های شیمیایی را افزایش دهد.
ویژگی های نرم افزار آووگادرو
- پشتیبانی از بسته شیمی کوانتومی ORCA، از جمله تولید ورودی و تجزیه و تحلیل خروجی
- پشتیبانی از محاسبات MO، از جمله اوربیتال هایی با F ، G ، H و حرکت زاویه ای
- پشتیبانی از مدل های VRML از اتم ها، پیوندها، سطح ها و اوربیتال ها (به عنوان مثال برای چاپ سه بعدی)
- پشتیبانی از درک تقارن مولکولی در Mac و Linux
- پشتیبانی ثابت برای کامپایل با کتابخانه Eigen3 تا نسخه 3.2.8
- پشتیبانی از گروه های فضایی از طریق spglib
- پشتیبانی از 25 زبان علاوه بر زبان انگلیسی
مزایای نرم افزار Avogadro
نرم افزار آووگادرو یک چارچوب ارائه دهنده کتابخانه کد و رابط برنامه نویسی برنامه (API) با قابلیت تجسم سه بعدی است و کاربردهای مستقیمی برای تحقیق و آموزش در زمینه های شیمی، فیزیک، علوم مواد و زیست شناسی دارد. نرم افزار آووگادرو یک رابط گرافیکی غنی را با استفاده از پلاگین های بارگیری پویا از طریق خود کتابخانه فراهم می کند. برنامه و کتابخانه را می توان با پیاده سازی یک ماژول پلاگین در C ++ یا Python برای کشف تکنیک های مختلف تجسم، ساخت یا دستکاری ساختارهای مولکولی و تعامل با برنامه های دیگر گسترش داد.
نتیجه گیری
نرم افزار آووگادرو سازنده و بستر شیمیایی معنایی را برای تجسم و تجزیه و تحلیل ارائه می دهد. برای کاربران سازنده ای آسان برای استفاده، پشتیبانی یکپارچه برای بارگیری از پایگاه داده های رایج مانند PubChem و بانک اطلاعات پروتئین، استخراج داده های شیمیایی از طیف گسترده ای از قالب ها از جمله خروجی شیمی محاسباتی و پشتیبانی بومی، معنایی برای قالب فایل CML. برای توسعه دهندگان می توان آن را به راحتی از طریق یک مکانیسم پلاگین قدرتمند گسترش داد تا از ویژگی های جدید در شیمی آلی، مجتمع های غیر آلی، طراحی دارو، مواد، مولکول های زیستی و شبیه سازی ها پشتیبانی کند.
دانلود نرم افزار آووگادرو (Avogadro)
منبع: کافه جزوه
